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7898265800
commit
bb90b69df0
GPG Key ID:
947ADABD8533C476
@ -0,0 +1,19 @@ |
|||||||
|
package net.lensfrex.dscape.auth; |
||||||
|
|
||||||
|
import cn.dev33.satoken.stp.StpInterface; |
||||||
|
import org.springframework.stereotype.Component; |
||||||
|
|
||||||
|
import java.util.List; |
||||||
|
|
||||||
|
@Component |
||||||
|
public class StpInterfaceImpl implements StpInterface { |
||||||
|
@Override |
||||||
|
public List<String> getPermissionList(Object loginId, String loginType) { |
||||||
|
return null; |
||||||
|
} |
||||||
|
|
||||||
|
@Override |
||||||
|
public List<String> getRoleList(Object loginId, String loginType) { |
||||||
|
return null; |
||||||
|
} |
||||||
|
} |
||||||
@ -0,0 +1,49 @@ |
|||||||
|
package net.lensfrex.dscape.configure; |
||||||
|
|
||||||
|
import com.baomidou.mybatisplus.annotation.DbType; |
||||||
|
import com.baomidou.mybatisplus.extension.plugins.MybatisPlusInterceptor; |
||||||
|
import com.baomidou.mybatisplus.extension.plugins.inner.PaginationInnerInterceptor; |
||||||
|
import lombok.extern.slf4j.Slf4j; |
||||||
|
import org.springframework.boot.autoconfigure.jdbc.DataSourceProperties; |
||||||
|
import org.springframework.context.annotation.Bean; |
||||||
|
import org.springframework.context.annotation.Configuration; |
||||||
|
|
||||||
|
import javax.annotation.Resource; |
||||||
|
|
||||||
|
/** |
||||||
|
* 分页功能的配置类 |
||||||
|
*/ |
||||||
|
@Slf4j |
||||||
|
@Configuration |
||||||
|
public class MybatisPlusConfigure { |
||||||
|
@Resource |
||||||
|
DataSourceProperties dataSourceProperties; |
||||||
|
|
||||||
|
@Bean |
||||||
|
public PaginationInnerInterceptor paginationInnerInterceptor() { |
||||||
|
return new PaginationInnerInterceptor(); |
||||||
|
} |
||||||
|
|
||||||
|
@Bean |
||||||
|
public MybatisPlusInterceptor mybatisPlusInterceptor() { |
||||||
|
MybatisPlusInterceptor interceptor = new MybatisPlusInterceptor(); |
||||||
|
String databaseDriverName = dataSourceProperties.getDriverClassName(); |
||||||
|
|
||||||
|
PaginationInnerInterceptor paginationInnerInterceptor; |
||||||
|
if (databaseDriverName.contains("mariadb")) { |
||||||
|
log.info("使用Mariadb作为数据库"); |
||||||
|
paginationInnerInterceptor = new PaginationInnerInterceptor(DbType.MARIADB); |
||||||
|
} else if (databaseDriverName.contains("mysql")) { |
||||||
|
log.info("使用Mysql作为数据库"); |
||||||
|
paginationInnerInterceptor = new PaginationInnerInterceptor(DbType.MYSQL); |
||||||
|
} else { |
||||||
|
paginationInnerInterceptor = new PaginationInnerInterceptor(); |
||||||
|
log.warn("使用了可能不受支持的数据库：" + databaseDriverName); |
||||||
|
} |
||||||
|
paginationInnerInterceptor.setOptimizeJoin(true); |
||||||
|
|
||||||
|
interceptor.addInnerInterceptor(paginationInnerInterceptor); |
||||||
|
return interceptor; |
||||||
|
} |
||||||
|
|
||||||
|
} |
||||||
@ -0,0 +1,29 @@ |
|||||||
|
package net.lensfrex.dscape.configure; |
||||||
|
|
||||||
|
import org.springframework.cache.annotation.CachingConfigurerSupport; |
||||||
|
import org.springframework.cache.annotation.EnableCaching; |
||||||
|
import org.springframework.context.annotation.Bean; |
||||||
|
import org.springframework.context.annotation.Configuration; |
||||||
|
import org.springframework.data.redis.connection.lettuce.LettuceConnectionFactory; |
||||||
|
import org.springframework.data.redis.core.RedisTemplate; |
||||||
|
import org.springframework.data.redis.serializer.Jackson2JsonRedisSerializer; |
||||||
|
import org.springframework.data.redis.serializer.StringRedisSerializer; |
||||||
|
|
||||||
|
@Configuration |
||||||
|
@EnableCaching |
||||||
|
public class RedisConfigure extends CachingConfigurerSupport { |
||||||
|
@Bean |
||||||
|
public RedisTemplate<String, Object> redisTemplate(LettuceConnectionFactory redisConnectionFactory) { |
||||||
|
RedisTemplate<String, Object> redisTemplate = new RedisTemplate<>(); |
||||||
|
redisTemplate.setConnectionFactory(redisConnectionFactory); |
||||||
|
Jackson2JsonRedisSerializer<Object> jackson2JsonRedisSerializer = new Jackson2JsonRedisSerializer<>(Object.class); |
||||||
|
|
||||||
|
redisTemplate.setValueSerializer(jackson2JsonRedisSerializer); |
||||||
|
redisTemplate.setKeySerializer(new StringRedisSerializer()); |
||||||
|
redisTemplate.setHashKeySerializer(new StringRedisSerializer()); |
||||||
|
|
||||||
|
redisTemplate.afterPropertiesSet(); |
||||||
|
|
||||||
|
return redisTemplate; |
||||||
|
} |
||||||
|
} |
||||||
@ -1,12 +0,0 @@ |
|||||||
/* |
|
||||||
* Class created by lensfrex. |
|
||||||
*/ |
|
||||||
|
|
||||||
/* |
|
||||||
* Class created by lensfrex. |
|
||||||
*/ |
|
||||||
|
|
||||||
package net.lensfrex.dscape.dao; |
|
||||||
|
|
||||||
public class PatientDataDao { |
|
||||||
} |
|
||||||
@ -1,5 +0,0 @@ |
|||||||
package net.lensfrex.dscape.dao; |
|
||||||
|
|
||||||
public class UserBasicDao { |
|
||||||
|
|
||||||
} |
|
||||||
@ -0,0 +1,35 @@ |
|||||||
|
package net.lensfrex.dscape.dao.entity; |
||||||
|
|
||||||
|
import lombok.Data; |
||||||
|
import java.io.Serializable; |
||||||
|
import com.baomidou.mybatisplus.annotation.IdType; |
||||||
|
import com.baomidou.mybatisplus.annotation.TableId; |
||||||
|
|
||||||
|
/** |
||||||
|
* @description compute_history |
||||||
|
* @author lensfrex |
||||||
|
* @date 2022-08-17 |
||||||
|
*/ |
||||||
|
@Data |
||||||
|
public class ComputeHistory implements Serializable { |
||||||
|
|
||||||
|
private static final long serialVersionUID = 1L; |
||||||
|
|
||||||
|
@TableId(type = IdType.AUTO) |
||||||
|
/** |
||||||
|
* id |
||||||
|
*/ |
||||||
|
private Integer id; |
||||||
|
|
||||||
|
/** |
||||||
|
* 计算数据记录对应的用户uid |
||||||
|
*/ |
||||||
|
private String uid; |
||||||
|
|
||||||
|
/** |
||||||
|
* 计算数据记录对应的患者数据id |
||||||
|
*/ |
||||||
|
private Integer rid; |
||||||
|
|
||||||
|
public ComputeHistory() {} |
||||||
|
} |
||||||
@ -0,0 +1,67 @@ |
|||||||
|
package net.lensfrex.dscape.dao.entity; |
||||||
|
|
||||||
|
import lombok.Data; |
||||||
|
import java.io.Serializable; |
||||||
|
import java.time.LocalDateTime; |
||||||
|
|
||||||
|
import com.baomidou.mybatisplus.annotation.IdType; |
||||||
|
import com.baomidou.mybatisplus.annotation.TableId; |
||||||
|
|
||||||
|
/** |
||||||
|
* @description patient_data |
||||||
|
* @author lensfrex |
||||||
|
* @date 2022-08-17 |
||||||
|
*/ |
||||||
|
@Data |
||||||
|
public class PatientData implements Serializable { |
||||||
|
|
||||||
|
private static final long serialVersionUID = 1L; |
||||||
|
|
||||||
|
/** |
||||||
|
* 数据id |
||||||
|
*/ |
||||||
|
@TableId(type = IdType.AUTO) |
||||||
|
private Integer id; |
||||||
|
|
||||||
|
/** |
||||||
|
* 病人id |
||||||
|
*/ |
||||||
|
private Integer pid; |
||||||
|
|
||||||
|
/** |
||||||
|
* ctdna长度 |
||||||
|
*/ |
||||||
|
private Integer ctdnaLength; |
||||||
|
|
||||||
|
/** |
||||||
|
* 甲基化位点数 |
||||||
|
*/ |
||||||
|
private Integer cpg; |
||||||
|
|
||||||
|
/** |
||||||
|
* 是否为hcc，0: 否， 1: 是 |
||||||
|
*/ |
||||||
|
private int isHcc; |
||||||
|
|
||||||
|
/** |
||||||
|
* 通过推断得出的hcc状态 |
||||||
|
*/ |
||||||
|
private int isInferHcc; |
||||||
|
|
||||||
|
/** |
||||||
|
* create_time |
||||||
|
*/ |
||||||
|
private LocalDateTime createTime; |
||||||
|
|
||||||
|
/** |
||||||
|
* edit_time |
||||||
|
*/ |
||||||
|
private LocalDateTime editTime; |
||||||
|
|
||||||
|
/** |
||||||
|
* is_deleted |
||||||
|
*/ |
||||||
|
private int isDeleted; |
||||||
|
|
||||||
|
public PatientData() {} |
||||||
|
} |
||||||
@ -0,0 +1,72 @@ |
|||||||
|
package net.lensfrex.dscape.dao.entity; |
||||||
|
|
||||||
|
import lombok.Data; |
||||||
|
import java.io.Serializable; |
||||||
|
import java.time.LocalDateTime; |
||||||
|
|
||||||
|
import com.baomidou.mybatisplus.annotation.IdType; |
||||||
|
import com.baomidou.mybatisplus.annotation.TableId; |
||||||
|
|
||||||
|
/** |
||||||
|
* @description user_basic |
||||||
|
* @author lensfrex |
||||||
|
* @date 2022-08-17 |
||||||
|
*/ |
||||||
|
@Data |
||||||
|
public class UserBasic implements Serializable { |
||||||
|
|
||||||
|
private static final long serialVersionUID = 1L; |
||||||
|
|
||||||
|
/** |
||||||
|
* id |
||||||
|
*/ |
||||||
|
@TableId(type = IdType.AUTO) |
||||||
|
private Integer id; |
||||||
|
|
||||||
|
/** |
||||||
|
* 用户唯一uuid |
||||||
|
*/ |
||||||
|
private String uid; |
||||||
|
|
||||||
|
/** |
||||||
|
* 用户用户名 |
||||||
|
*/ |
||||||
|
private String userName; |
||||||
|
|
||||||
|
/** |
||||||
|
* 用户密码 |
||||||
|
*/ |
||||||
|
private String password; |
||||||
|
|
||||||
|
/** |
||||||
|
* 账号对应的上级管理员，若无上级管理员，请设为“null”（字符串） |
||||||
|
*/ |
||||||
|
private String superior; |
||||||
|
|
||||||
|
/** |
||||||
|
* 用户注册ip |
||||||
|
*/ |
||||||
|
private String createIp; |
||||||
|
|
||||||
|
/** |
||||||
|
* 用户状态；0：正常；1：封禁；2：注销（销号）;3：未激活 |
||||||
|
*/ |
||||||
|
private int status; |
||||||
|
|
||||||
|
/** |
||||||
|
* create_time |
||||||
|
*/ |
||||||
|
private LocalDateTime createTime; |
||||||
|
|
||||||
|
/** |
||||||
|
* edit_time |
||||||
|
*/ |
||||||
|
private LocalDateTime editTime; |
||||||
|
|
||||||
|
/** |
||||||
|
* is_deleted |
||||||
|
*/ |
||||||
|
private int isDeleted; |
||||||
|
|
||||||
|
public UserBasic() {} |
||||||
|
} |
||||||
@ -1,12 +0,0 @@ |
|||||||
/* |
|
||||||
* Class created by lensfrex. |
|
||||||
*/ |
|
||||||
|
|
||||||
package net.lensfrex.dscape.dao.mappers; |
|
||||||
|
|
||||||
import com.baomidou.mybatisplus.core.mapper.BaseMapper; |
|
||||||
import net.lensfrex.dscape.domain.PatientData; |
|
||||||
|
|
||||||
public interface PatientDataMapper extends BaseMapper<PatientData> { |
|
||||||
|
|
||||||
} |
|
||||||
@ -1,10 +0,0 @@ |
|||||||
package net.lensfrex.dscape.dao.mappers; |
|
||||||
|
|
||||||
import com.baomidou.mybatisplus.core.mapper.BaseMapper; |
|
||||||
import net.lensfrex.dscape.domain.user.UserBasic; |
|
||||||
import org.springframework.stereotype.Repository; |
|
||||||
|
|
||||||
@Repository |
|
||||||
public interface UserBasicMapper extends BaseMapper<UserBasic> { |
|
||||||
|
|
||||||
} |
|
||||||
@ -1,142 +0,0 @@ |
|||||||
package net.lensfrex.dscape.domain; |
|
||||||
|
|
||||||
import com.baomidou.mybatisplus.annotation.TableName; |
|
||||||
|
|
||||||
import java.util.Date; |
|
||||||
|
|
||||||
@TableName("patient_data") |
|
||||||
public class PatientData { |
|
||||||
|
|
||||||
/** |
|
||||||
* 患者数据id |
|
||||||
*/ |
|
||||||
private int id; |
|
||||||
|
|
||||||
/** |
|
||||||
* 病人id |
|
||||||
*/ |
|
||||||
private int pid; |
|
||||||
|
|
||||||
/** |
|
||||||
* ctDNA长度 |
|
||||||
*/ |
|
||||||
private int ctDNALength; |
|
||||||
|
|
||||||
/** |
|
||||||
* 甲基化位点数 |
|
||||||
*/ |
|
||||||
private int cpg; |
|
||||||
|
|
||||||
/** |
|
||||||
* 是否为hcc |
|
||||||
*/ |
|
||||||
private boolean hccStatus; |
|
||||||
|
|
||||||
/** |
|
||||||
* 通过推断得出的hcc状态 |
|
||||||
*/ |
|
||||||
private boolean hccInferStatus; |
|
||||||
|
|
||||||
/** |
|
||||||
* create_time |
|
||||||
*/ |
|
||||||
private Date createTime; |
|
||||||
|
|
||||||
/** |
|
||||||
* edit_time |
|
||||||
*/ |
|
||||||
private Date editTime; |
|
||||||
|
|
||||||
/** |
|
||||||
* delete |
|
||||||
*/ |
|
||||||
private boolean delete; |
|
||||||
|
|
||||||
public PatientData() {} |
|
||||||
|
|
||||||
public int getId() { |
|
||||||
return id; |
|
||||||
} |
|
||||||
|
|
||||||
public void setId(int id) { |
|
||||||
this.id = id; |
|
||||||
} |
|
||||||
|
|
||||||
public int getPid() { |
|
||||||
return pid; |
|
||||||
} |
|
||||||
|
|
||||||
public void setPid(int pid) { |
|
||||||
this.pid = pid; |
|
||||||
} |
|
||||||
|
|
||||||
public int getCtDNALength() { |
|
||||||
return ctDNALength; |
|
||||||
} |
|
||||||
|
|
||||||
public void setCtDNALength(int ctDNALength) { |
|
||||||
this.ctDNALength = ctDNALength; |
|
||||||
} |
|
||||||
|
|
||||||
public boolean isHccStatus() { |
|
||||||
return hccStatus; |
|
||||||
} |
|
||||||
|
|
||||||
public void setHccStatus(boolean hccStatus) { |
|
||||||
this.hccStatus = hccStatus; |
|
||||||
} |
|
||||||
|
|
||||||
public boolean isHccInferStatus() { |
|
||||||
return hccInferStatus; |
|
||||||
} |
|
||||||
|
|
||||||
public void setHccInferStatus(boolean hccInferStatus) { |
|
||||||
this.hccInferStatus = hccInferStatus; |
|
||||||
} |
|
||||||
|
|
||||||
public boolean isDelete() { |
|
||||||
return delete; |
|
||||||
} |
|
||||||
|
|
||||||
public void setDelete(boolean delete) { |
|
||||||
this.delete = delete; |
|
||||||
} |
|
||||||
|
|
||||||
public int getCpg() { |
|
||||||
return cpg; |
|
||||||
} |
|
||||||
|
|
||||||
public void setCpg(int cpg) { |
|
||||||
this.cpg = cpg; |
|
||||||
} |
|
||||||
|
|
||||||
public Date getCreateTime() { |
|
||||||
return createTime; |
|
||||||
} |
|
||||||
|
|
||||||
public void setCreateTime(Date createTime) { |
|
||||||
this.createTime = createTime; |
|
||||||
} |
|
||||||
|
|
||||||
public Date getEditTime() { |
|
||||||
return editTime; |
|
||||||
} |
|
||||||
|
|
||||||
public void setEditTime(Date editTime) { |
|
||||||
this.editTime = editTime; |
|
||||||
} |
|
||||||
|
|
||||||
@Override |
|
||||||
public String toString() { |
|
||||||
return "PatientData{" + "id=" + id + |
|
||||||
", pid=" + pid + |
|
||||||
", ctDNALength=" + ctDNALength + |
|
||||||
", cpg=" + cpg + |
|
||||||
", hccStatus=" + hccStatus + |
|
||||||
", hccInferStatus=" + hccInferStatus + |
|
||||||
", createTime=" + createTime + |
|
||||||
", editTime=" + editTime + |
|
||||||
", delete=" + delete + |
|
||||||
'}'; |
|
||||||
} |
|
||||||
} |
|
||||||
@ -1,5 +1,5 @@ |
|||||||
|
|
||||||
package net.lensfrex.dscape.domain.response.data.admin; |
package net.lensfrex.dscape.dto.response.data.admin; |
||||||
|
|
||||||
import javax.annotation.Generated; |
import javax.annotation.Generated; |
||||||
import com.google.gson.annotations.Expose; |
import com.google.gson.annotations.Expose; |
||||||
@ -0,0 +1,35 @@ |
|||||||
|
/* |
||||||
|
* Class created by lensfrex. |
||||||
|
*/ |
||||||
|
|
||||||
|
package net.lensfrex.dscape.dto.response.general; |
||||||
|
|
||||||
|
public enum ResponseCode { |
||||||
|
SUCCESS(20000, "成功"), |
||||||
|
INVALID_REQUEST(30000, "非法请求"), |
||||||
|
PARAM_WRONG(30001, "参数错误"), |
||||||
|
PERMISSION_DENIED(40000, "权限不足"), |
||||||
|
TOKEN_EXPIRED(40001, "token过期"), |
||||||
|
TOKEN_INVALID(40002, "token无效"), |
||||||
|
SERVER_INTERNAL_ERROR(50000, "服务器内部错误"), |
||||||
|
API_NOT_IMPLEMENT(0, "接口未实现"), |
||||||
|
|
||||||
|
; |
||||||
|
|
||||||
|
private final int code; |
||||||
|
|
||||||
|
private final String message; |
||||||
|
|
||||||
|
ResponseCode(int code, String message) { |
||||||
|
this.code = code; |
||||||
|
this.message = message; |
||||||
|
} |
||||||
|
|
||||||
|
public int getCode() { |
||||||
|
return code; |
||||||
|
} |
||||||
|
|
||||||
|
public String getMessage() { |
||||||
|
return message; |
||||||
|
} |
||||||
|
} |
||||||
@ -1,4 +1,4 @@ |
|||||||
package net.lensfrex.dscape.domain.user; |
package net.lensfrex.dscape.enums.user; |
||||||
|
|
||||||
public class UserBasic { |
public class UserBasic { |
||||||
private String uid; |
private String uid; |
||||||
@ -1,4 +1,4 @@ |
|||||||
package net.lensfrex.dscape.domain.user; |
package net.lensfrex.dscape.enums.user; |
||||||
|
|
||||||
import com.baomidou.mybatisplus.annotation.EnumValue; |
import com.baomidou.mybatisplus.annotation.EnumValue; |
||||||
|
|
||||||
@ -1,4 +1,4 @@ |
|||||||
package net.lensfrex.dscape.domain.user; |
package net.lensfrex.dscape.enums.user; |
||||||
|
|
||||||
import com.baomidou.mybatisplus.annotation.EnumValue; |
import com.baomidou.mybatisplus.annotation.EnumValue; |
||||||
|
|
||||||
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